Действие происходит во вселенной Gundam, где события и персонажи связаны с исходной историей Mobile Suit Gundam. Продолжением этой истории является Gundam Z. В оригинальном сериале юноша Амуро Рэй сражался на стороне Земной Федерации против Княжества Зион, что привело к победе Федерации. Однако этот конфликт не принес стабильности, а стал причиной формирования новой военизированной организации — Титанов.
В ответ на действия Титанов был создан Союз борцов с Землей (AEUG), целью которого стало уничтожение этой организации. В состав AEUG вошли бывшие пилоты как Земной Федерации, так и Княжества Зион. Спустя несколько лет, в 0087 году по универсальному веку, происходит инцидент с участием Камилём Виданом. После ареста за драку ему удается сбежать на экспериментальном мобильном доспехе Gundam Mk-II, воспользовавшись хаосом, вызванным атакой сил AEUG на колонию.
Этот побег оказывается кратковременным, и Камиль вскоре попадает в руки к членам AEUG. Перед ним встает сложный выбор, требующий определить, кто является союзником, а кто — противником. Этот выбор осложняется личными обстоятельствами и затрагивает судьбы его близких. В результате Камиль принимает решение пересмотреть свои первоначальные убеждения и присоединиться к AEUG для борьбы против Титанов.