Детектив Конан: Алое алиби

События сериала сосредоточены на девушке по кодовому имени Ноль Два. Она, как и другие персонажи в её окружении, идентифицируется подобным номером. В начале повествования у героини наблюдаются провалы в памяти неизвестного происхождения. Единственное, что она может чётко вспомнить, — это факт своего заключения. Предшествующие этому события полностью стёрты из её памяти. Периодически Ноль Два видит фрагментарные воспоминания о женщине, исполнявшей роль её матери. Эта женщина сыграла значительную роль в формировании личности героини. Позже в памяти девушки возникает эпизод, связанный с книгой с иллюстрациями, которую принесла её опекун.

Содержание книги не привлекло внимания Ноль Два, в отличие от изображений внутри неё. В ходе развития сюжета выясняется, что несколько лет назад над героиней проводились нестандартные эксперименты в месте под названием «Сад». «Сад» представлял собой лабораторию, специализирующуюся на подобных исследованиях. Находясь в этой лаборатории, Ноль Два познакомилась с мальчиком по имени Хиро, имевшим кодовый номер Ноль Шестнадцать. Они совместно предприняли попытку побега, которая была почти сразу пресечена. В этот момент Хиро даёт обещание когда-нибудь жениться на Ноль Два.

После поимки память обоим беглецам была стёрта, что привело к взаимному забвению. Однако в определённый момент Ноль Два начинает вспоминать человека, к которому испытывала чувства. Это побуждает её начать поиски, чтобы вновь его найти, несмотря на утраченные воспоминания и существующие препятствия.